Pendirian UPT Puskesmas Wanaraja pertama kali pada tahun 1975 lokasinya di alun-alun wanaraja Kecamatan Wanaraja.Setelah berjalan sampai tahun 1986 kemudian UPT Puskesmas Wanaraja pindah ke Kampung Tegal Sari Desa Tegal Panjang Kecamatan Wanaraja dari tahun 1986 sampai 2019, setelah di adakannya pemekaran dari pada kecamatan,lokasi tersebut menjadi lokasi Puskesmas Sucinaraja.

Dari tahun 2019 UPT Puskesmas Wanaraja di relokasi ke jalan Talaga Bodas Desa Wanamekar Kecamatan Wanaraja sampai sekarang